86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2261 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  49.04 
 
 
1746 aa  1279    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  97.55 
 
 
2383 aa  4488    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  97.6 
 
 
2358 aa  4491    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  40.82 
 
 
2933 aa  1228    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  97.55 
 
 
2367 aa  4490    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  100 
 
 
2296 aa  4661    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  97.64 
 
 
2358 aa  4489    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  72.16 
 
 
2620 aa  2522    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  32.23 
 
 
1418 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  32.52 
 
 
1417 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  32.79 
 
 
1396 aa  550  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.55 
 
 
1417 aa  546  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  29.02 
 
 
2933 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  29.76 
 
 
2795 aa  526  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  30.34 
 
 
1976 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  45.24 
 
 
1417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  40.04 
 
 
5337 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  41.47 
 
 
4953 aa  424  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  34.31 
 
 
1050 aa  399  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  34.31 
 
 
1075 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  33.1 
 
 
1075 aa  396  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  43.89 
 
 
1084 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  54.94 
 
 
410 aa  322  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  40.32 
 
 
969 aa  321  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  40.32 
 
 
941 aa  320  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  39.9 
 
 
934 aa  296  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  55.51 
 
 
295 aa  290  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  55.51 
 
 
292 aa  290  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  37.74 
 
 
730 aa  266  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  37.02 
 
 
730 aa  259  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  37.02 
 
 
730 aa  259  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  37.02 
 
 
730 aa  258  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  34.64 
 
 
724 aa  252  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  36.78 
 
 
730 aa  249  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  31.46 
 
 
468 aa  186  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  31.05 
 
 
497 aa  184  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  28.51 
 
 
509 aa  166  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  29.48 
 
 
474 aa  165  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  29.48 
 
 
474 aa  164  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  29.48 
 
 
474 aa  164  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  32.13 
 
 
464 aa  163  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  32.13 
 
 
464 aa  164  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  32.13 
 
 
476 aa  163  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  37 
 
 
660 aa  162  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  32.13 
 
 
476 aa  162  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  32.13 
 
 
464 aa  162  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.13 
 
 
417 aa  162  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.13 
 
 
417 aa  162  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  29.24 
 
 
474 aa  161  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  37 
 
 
660 aa  161  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  36.16 
 
 
660 aa  160  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  32.13 
 
 
464 aa  161  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  36.16 
 
 
660 aa  160  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  36.63 
 
 
660 aa  159  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  31.86 
 
 
464 aa  159  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  30.29 
 
 
690 aa  140  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  32.8 
 
 
1459 aa  114  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  33.01 
 
 
543 aa  93.2  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  26.15 
 
 
845 aa  72.8  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  25.8 
 
 
3209 aa  68.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  25.4 
 
 
4672 aa  68.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  26.5 
 
 
727 aa  64.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  27.5 
 
 
830 aa  60.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  33.11 
 
 
811 aa  59.3  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  26.8 
 
 
614 aa  58.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  28 
 
 
609 aa  58.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  32.92 
 
 
1005 aa  56.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  26.42 
 
 
1209 aa  55.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  26.16 
 
 
1224 aa  55.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  26.16 
 
 
1224 aa  55.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  37.61 
 
 
633 aa  53.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  32.71 
 
 
302 aa  53.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  30.06 
 
 
857 aa  53.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  30.07 
 
 
850 aa  53.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  25.71 
 
 
1209 aa  53.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  27.81 
 
 
507 aa  52.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  37.37 
 
 
372 aa  52.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1937  Ig domain-containing protein  28.13 
 
 
528 aa  52  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  29.09 
 
 
1002 aa  49.7  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  28.02 
 
 
1504 aa  49.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  22.99 
 
 
1164 aa  48.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0979  Ig domain-containing protein  22.92 
 
 
1630 aa  47.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  25.64 
 
 
1224 aa  47.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  25.67 
 
 
1279 aa  47  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  24.94 
 
 
1237 aa  45.8  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2009  intimin/invasin family protein  25.09 
 
 
507 aa  45.8  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>