11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2009 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2009  intimin/invasin family protein  100 
 
 		 507 aa  1013    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1934  intimin/invasin family protein  96.53 
 
 		 294 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1931  intimin/invasin family protein  98.24 
 
 		 230 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  28.47 
 
 		 2620 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  27.57 
 
 		 5337 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  25.09 
 
 		 2296 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  25.63 
 
 		 2358 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  29.23 
 
 		 934 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  24.73 
 
 		 2383 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  24.73 
 
 		 2358 aa  43.9  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  24.73 
 
 		 2367 aa  43.9  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>