58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2901 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1014    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  48.62 
 
 
468 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  49.28 
 
 
474 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  49.28 
 
 
474 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  49.28 
 
 
509 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  49.28 
 
 
474 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  49.04 
 
 
474 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  44.12 
 
 
476 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  44.71 
 
 
464 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  44.71 
 
 
464 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  43.91 
 
 
476 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  44.71 
 
 
464 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  44.49 
 
 
464 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  47.1 
 
 
417 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  44.28 
 
 
464 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  47.1 
 
 
417 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  35.2 
 
 
730 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  34.84 
 
 
730 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  34.84 
 
 
730 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  33.62 
 
 
730 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  34.17 
 
 
724 aa  246  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  34.84 
 
 
730 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  34.58 
 
 
1417 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  34.7 
 
 
1396 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  34.7 
 
 
1418 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.85 
 
 
1417 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  34.34 
 
 
1976 aa  220  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  34.7 
 
 
1417 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  33.51 
 
 
4953 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  33.51 
 
 
5337 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  34.34 
 
 
2795 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  33.51 
 
 
2933 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  33.51 
 
 
1075 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  33.51 
 
 
1050 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  33.51 
 
 
1075 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  34.29 
 
 
2933 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  30.2 
 
 
969 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  31.14 
 
 
941 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  31.51 
 
 
1746 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  29.24 
 
 
934 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  30.81 
 
 
2358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  31.05 
 
 
2296 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  30.9 
 
 
2367 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  30.9 
 
 
2383 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  30.9 
 
 
2358 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  30.54 
 
 
2620 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  36.43 
 
 
410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  31.56 
 
 
660 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.31 
 
 
1084 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  31.3 
 
 
660 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  31.83 
 
 
660 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  31.56 
 
 
660 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  31.78 
 
 
660 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  36.91 
 
 
295 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  37.07 
 
 
292 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  26.37 
 
 
1459 aa  90.9  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  28.51 
 
 
690 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  25.84 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>