66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2754 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  100 
 
 
730 aa  1514    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  97.12 
 
 
730 aa  1483    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  97.12 
 
 
730 aa  1480    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  96.85 
 
 
730 aa  1477    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  96.58 
 
 
730 aa  1447    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  73.19 
 
 
724 aa  1135    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  37.66 
 
 
1976 aa  293  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  46.81 
 
 
4953 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  38.74 
 
 
2795 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  46.81 
 
 
5337 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  46.81 
 
 
2933 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  46.82 
 
 
2933 aa  281  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  38.07 
 
 
1417 aa  280  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  42.6 
 
 
1417 aa  279  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  42.6 
 
 
1396 aa  279  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  42.6 
 
 
1418 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  42.3 
 
 
1417 aa  277  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  37.98 
 
 
2358 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  38.22 
 
 
2383 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  38.22 
 
 
2367 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  38.22 
 
 
2358 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  38.46 
 
 
2620 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  35.66 
 
 
1075 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  35.66 
 
 
1075 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  35.08 
 
 
934 aa  266  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  37.92 
 
 
1084 aa  266  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  33.33 
 
 
969 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  37.74 
 
 
2296 aa  266  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  35.43 
 
 
1050 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  36.19 
 
 
941 aa  264  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  44.75 
 
 
1746 aa  262  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  35.2 
 
 
497 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.67 
 
 
468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  46.41 
 
 
410 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  31.59 
 
 
464 aa  218  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  31.38 
 
 
476 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  31.38 
 
 
464 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  31.38 
 
 
464 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  31.38 
 
 
476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  32.4 
 
 
509 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  31.38 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  32.67 
 
 
474 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  32.61 
 
 
474 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  32.96 
 
 
474 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  31.17 
 
 
464 aa  212  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  32.67 
 
 
474 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  49 
 
 
295 aa  206  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.84 
 
 
417 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.84 
 
 
417 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  49 
 
 
292 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  32.05 
 
 
660 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  31.84 
 
 
660 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  31.84 
 
 
660 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  31.84 
 
 
660 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  31.2 
 
 
660 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  36.02 
 
 
1459 aa  151  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  29.92 
 
 
690 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  33.82 
 
 
543 aa  104  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2710  hypothetical protein  35.94 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2773  hypothetical protein  35.43 
 
 
320 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2753  hypothetical protein  36 
 
 
321 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0353095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2884  putative outer membrane protein  35.48 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  38.56 
 
 
372 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2667  hypothetical protein  35.2 
 
 
323 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  30.28 
 
 
302 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2660  putative adhesin  28.81 
 
 
330 aa  45.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.468628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>