58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2403 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  73.95 
 
 
474 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  73.74 
 
 
474 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  99.14 
 
 
464 aa  943    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  74.37 
 
 
474 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  99.78 
 
 
464 aa  950    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  99.14 
 
 
464 aa  944    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  98.49 
 
 
464 aa  937    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  74.16 
 
 
509 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  977    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  69.37 
 
 
468 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  99.58 
 
 
476 aa  972    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  98.92 
 
 
464 aa  943    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  74.16 
 
 
474 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  857    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  100 
 
 
417 aa  857    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  43.91 
 
 
497 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  33.77 
 
 
1976 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  31.38 
 
 
730 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  33.51 
 
 
2795 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  32.36 
 
 
730 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  32.15 
 
 
730 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  32.15 
 
 
730 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  32.15 
 
 
730 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  31.98 
 
 
5337 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  35.64 
 
 
1417 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  35.08 
 
 
1417 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  35.08 
 
 
1418 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  31.53 
 
 
724 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  35.08 
 
 
1417 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  35.08 
 
 
1396 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  32.41 
 
 
969 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  33.7 
 
 
2933 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  32.16 
 
 
941 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  33.52 
 
 
1050 aa  202  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  33.7 
 
 
4953 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  33.52 
 
 
1075 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  33.24 
 
 
1075 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  31.95 
 
 
2933 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  32.13 
 
 
934 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  33.51 
 
 
1746 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  32.41 
 
 
2358 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  32.41 
 
 
2367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  32.41 
 
 
2383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  32.41 
 
 
2358 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  32.13 
 
 
2296 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  31.28 
 
 
1084 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  31.86 
 
 
2620 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  30.59 
 
 
660 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  30.32 
 
 
660 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  30.59 
 
 
660 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  30.59 
 
 
660 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  30.32 
 
 
660 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  37.9 
 
 
410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  35.42 
 
 
292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  35.23 
 
 
295 aa  120  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  29.02 
 
 
690 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  21.86 
 
 
1459 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  23.93 
 
 
543 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>