59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1963 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  77.7 
 
 
417 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  74.57 
 
 
464 aa  697    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  74.16 
 
 
476 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  74.14 
 
 
464 aa  691    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  99.16 
 
 
509 aa  968    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  976    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  98.52 
 
 
474 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  74.35 
 
 
464 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  75 
 
 
464 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  99.37 
 
 
474 aa  969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  98.95 
 
 
474 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  71.11 
 
 
468 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  77.7 
 
 
417 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  73.95 
 
 
476 aa  708    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  74.57 
 
 
464 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  46.94 
 
 
497 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  32.57 
 
 
730 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  32.54 
 
 
724 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  32.43 
 
 
730 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  32.43 
 
 
730 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  32.43 
 
 
730 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  33.42 
 
 
1976 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  33.16 
 
 
2795 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  34.11 
 
 
1417 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  34.11 
 
 
1418 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  31.28 
 
 
4953 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  31.28 
 
 
5337 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  34.11 
 
 
1417 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  34.11 
 
 
1396 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  32.43 
 
 
730 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  34.11 
 
 
1417 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  31.84 
 
 
969 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  31.59 
 
 
941 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  33.51 
 
 
1050 aa  200  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  33.51 
 
 
1075 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  33.24 
 
 
1075 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  31.3 
 
 
2933 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  31.04 
 
 
2933 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  29.01 
 
 
934 aa  176  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.03 
 
 
1084 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  29.98 
 
 
2358 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  29.72 
 
 
1746 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  29.98 
 
 
2367 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  29.98 
 
 
2383 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  29.98 
 
 
2358 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  29.48 
 
 
2296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  29.48 
 
 
2620 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  32.46 
 
 
660 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  32.16 
 
 
660 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  32.46 
 
 
660 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  32.16 
 
 
660 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  32.46 
 
 
660 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  35.27 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  27.41 
 
 
690 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  24.34 
 
 
1459 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  25.65 
 
 
543 aa  67  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  27.16 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>