59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1555 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  77.22 
 
 		 417 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  74.14 
 
 		 464 aa  691    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  73.74 
 
 		 476 aa  706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  73.71 
 
 		 464 aa  687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  98.52 
 
 		 509 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  98.95 
 
 		 474 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  98.31 
 
 		 474 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  73.92 
 
 		 464 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  74.57 
 
 		 464 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  98.73 
 
 		 474 aa  966    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  77.22 
 
 		 417 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  978    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  73.53 
 
 		 476 aa  703    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  74.14 
 
 		 464 aa  692    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  71.11 
 
 		 468 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  46.94 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  32.57 
 
 		 730 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  32.11 
 
 		 724 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  32.22 
 
 		 730 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  32.22 
 
 		 730 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  32.22 
 
 		 730 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 1976 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  32.91 
 
 		 2795 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  33.68 
 
 		 1417 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  33.68 
 
 		 1418 aa  203  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  33.68 
 
 		 1396 aa  203  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  33.68 
 
 		 1417 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  30.77 
 
 		 5337 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  30.77 
 
 		 4953 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.68 
 
 		 1417 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  31.34 
 
 		 969 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  32.22 
 
 		 730 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  33.88 
 
 		 1050 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  33.88 
 
 		 1075 aa  200  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  33.6 
 
 		 1075 aa  199  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  31.09 
 
 		 941 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  31.46 
 
 		 2933 aa  194  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  31.04 
 
 		 2933 aa  176  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.03 
 
 		 1084 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  28.79 
 
 		 934 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  29.48 
 
 		 1746 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  29.73 
 
 		 2358 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  29.73 
 
 		 2367 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  29.73 
 
 		 2383 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  29.73 
 
 		 2358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  29.24 
 
 		 2296 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  32.46 
 
 		 660 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  29.24 
 
 		 2620 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  32.16 
 
 		 660 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  32.46 
 
 		 660 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  31.87 
 
 		 660 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  32.16 
 
 		 660 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  34.88 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  32.9 
 
 		 292 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  32.9 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  26.9 
 
 		 690 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  24.34 
 
 		 1459 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  25.32 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  30.43 
 
 		 302 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>