73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3322 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  91.32 
 
 
1417 aa  2630    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  91.25 
 
 
1417 aa  2592    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  91.98 
 
 
1396 aa  2583    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  100 
 
 
1418 aa  2883    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  92.8 
 
 
1417 aa  2657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  100 
 
 
410 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  99.66 
 
 
295 aa  635  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  34 
 
 
2933 aa  612  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  33.49 
 
 
2620 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  32.23 
 
 
2296 aa  555  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  32.24 
 
 
1746 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  34.62 
 
 
2795 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  34.35 
 
 
1976 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  38.55 
 
 
1075 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  44.95 
 
 
2367 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  38.61 
 
 
1050 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  44.95 
 
 
2383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  38.61 
 
 
1075 aa  473  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  44.95 
 
 
2358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  32.86 
 
 
2933 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  45.04 
 
 
2358 aa  466  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  32.86 
 
 
4953 aa  456  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  33.36 
 
 
5337 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.68 
 
 
1084 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  37.26 
 
 
969 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  37.26 
 
 
941 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  40.23 
 
 
934 aa  343  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  42.6 
 
 
730 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  41.69 
 
 
730 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  41.69 
 
 
730 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  41.69 
 
 
730 aa  272  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  41.69 
 
 
730 aa  264  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  35.03 
 
 
724 aa  258  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  34.7 
 
 
497 aa  220  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  35.25 
 
 
468 aa  210  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  34.11 
 
 
509 aa  206  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  34.11 
 
 
474 aa  205  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  34.11 
 
 
474 aa  205  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  33.68 
 
 
474 aa  202  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  33.59 
 
 
474 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  35.08 
 
 
476 aa  195  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  35.08 
 
 
476 aa  195  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  35.08 
 
 
464 aa  195  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  35.08 
 
 
464 aa  194  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  35.08 
 
 
464 aa  194  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  35.08 
 
 
417 aa  194  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  35.08 
 
 
417 aa  194  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  34.81 
 
 
464 aa  193  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  34.53 
 
 
464 aa  189  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  33.24 
 
 
660 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  33.24 
 
 
660 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  33.24 
 
 
660 aa  184  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  30.89 
 
 
690 aa  182  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  32.69 
 
 
660 aa  182  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  33.8 
 
 
660 aa  182  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  30.32 
 
 
4672 aa  141  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  30.89 
 
 
1459 aa  127  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  29.84 
 
 
543 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  31.35 
 
 
845 aa  67  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  27.15 
 
 
3209 aa  62.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  36.72 
 
 
372 aa  58.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  24.16 
 
 
1164 aa  54.3  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  28.95 
 
 
302 aa  54.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  39.77 
 
 
980 aa  53.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  39.77 
 
 
980 aa  53.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  39.77 
 
 
979 aa  53.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  39.77 
 
 
980 aa  53.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07116  hypothetical protein  28.12 
 
 
330 aa  48.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  35.29 
 
 
850 aa  48.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  33.88 
 
 
974 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  33.88 
 
 
974 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  25.17 
 
 
609 aa  45.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>