80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0145 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  35.05 
 
 		 2795 aa  908    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  73.59 
 
 		 4953 aa  5658    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  79.72 
 
 		 2933 aa  3514    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 5337 aa  10020    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  36.24 
 
 		 1976 aa  806    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  30.52 
 
 		 1746 aa  482  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  38.14 
 
 		 1075 aa  483  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  38.27 
 
 		 1050 aa  484  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  38.27 
 
 		 1075 aa  483  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  45.74 
 
 		 941 aa  476  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  45.57 
 
 		 969 aa  474  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  34 
 
 		 1417 aa  468  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  34.25 
 
 		 1396 aa  463  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.41 
 
 		 1417 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  33.78 
 
 		 1418 aa  455  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  39.29 
 
 		 2933 aa  451  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  33.2 
 
 		 1417 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  41.4 
 
 		 2367 aa  446  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  41.4 
 
 		 2383 aa  446  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  41.22 
 
 		 2358 aa  444  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  40.14 
 
 		 2358 aa  441  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  37.81 
 
 		 1084 aa  432  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  41.35 
 
 		 2620 aa  430  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  40.04 
 
 		 2296 aa  424  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  40.17 
 
 		 934 aa  365  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  47.87 
 
 		 730 aa  295  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  47.87 
 
 		 730 aa  295  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  47.87 
 
 		 730 aa  296  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  46.81 
 
 		 730 aa  292  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  47.87 
 
 		 730 aa  283  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  36.14 
 
 		 724 aa  284  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  52.28 
 
 		 410 aa  283  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  54.21 
 
 		 295 aa  255  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  54.21 
 
 		 292 aa  254  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  37.79 
 
 		 690 aa  226  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  33.51 
 
 		 497 aa  218  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  31.28 
 
 		 474 aa  207  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  32.22 
 
 		 464 aa  207  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  31.28 
 
 		 509 aa  206  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  31.28 
 
 		 474 aa  206  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  31.98 
 
 		 476 aa  204  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  31.98 
 
 		 464 aa  204  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  31.98 
 
 		 464 aa  204  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  31.42 
 
 		 417 aa  203  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  31.42 
 
 		 417 aa  203  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  31.98 
 
 		 476 aa  203  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  30.77 
 
 		 474 aa  202  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  31.98 
 
 		 464 aa  202  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  30.77 
 
 		 474 aa  202  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  31.74 
 
 		 464 aa  200  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.62 
 
 		 468 aa  195  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  37.32 
 
 		 660 aa  194  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  37.59 
 
 		 660 aa  194  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  37.5 
 
 		 660 aa  193  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  36.77 
 
 		 660 aa  192  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  36.45 
 
 		 660 aa  191  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  30.53 
 
 		 4672 aa  160  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  24.65 
 
 		 1459 aa  105  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  24.31 
 
 		 543 aa  90.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  28.05 
 
 		 980 aa  67.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  28.05 
 
 		 980 aa  65.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  28.25 
 
 		 980 aa  65.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  28.33 
 
 		 3209 aa  65.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  41.11 
 
 		 979 aa  64.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  29.31 
 
 		 974 aa  61.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  29.31 
 
 		 974 aa  61.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  26.35 
 
 		 1771 aa  59.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0979  Ig domain-containing protein  25.8 
 
 		 1630 aa  58.2  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1164 aa  56.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  26.3 
 
 		 609 aa  55.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4857  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1112 aa  54.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  31.67 
 
 		 633 aa  54.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  32.78 
 
 		 614 aa  53.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  26.12 
 
 		 845 aa  50.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 3230 aa  50.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2976  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1304 aa  50.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  26.96 
 
 		 1279 aa  48.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  26.74 
 
 		 727 aa  48.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2009  intimin/invasin family protein  26.83 
 
 		 507 aa  47  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1934  intimin/invasin family protein  27.92 
 
 		 294 aa  47.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>