32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2924 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  100 
 
 		 633 aa  1221    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  44.18 
 
 		 614 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  37.09 
 
 		 845 aa  269  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  33.61 
 
 		 727 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  36.22 
 
 		 609 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  29.85 
 
 		 670 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  26.79 
 
 		 667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  35.44 
 
 		 562 aa  125  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  27.68 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  29.58 
 
 		 830 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  33.85 
 
 		 4953 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2933 aa  67.4  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  30.75 
 
 		 5337 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  27.79 
 
 		 1084 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  30.07 
 
 		 2358 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  33.09 
 
 		 1075 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 1050 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  33.09 
 
 		 1075 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  29.19 
 
 		 2367 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  37.61 
 
 		 2296 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  29.19 
 
 		 2383 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  29.19 
 
 		 2358 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  28.91 
 
 		 2620 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  40.54 
 
 		 807 aa  48.5  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  29.8 
 
 		 2795 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  35.06 
 
 		 819 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  28.14 
 
 		 826 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  27.06 
 
 		 836 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  36.78 
 
 		 821 aa  44.3  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  27.87 
 
 		 851 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1198  hypothetical protein  30.34 
 
 		 271 aa  43.9  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249406  normal  0.127794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  29.34 
 
 		 837 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>