32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0821 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  100 
 
 
609 aa  1201    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  32.96 
 
 
727 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  32.47 
 
 
845 aa  267  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  34.95 
 
 
633 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  31.8 
 
 
614 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  29.39 
 
 
670 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  24.24 
 
 
667 aa  101  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  27.48 
 
 
4953 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  28.68 
 
 
562 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  25.46 
 
 
2358 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  28 
 
 
2296 aa  62  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  27.98 
 
 
2620 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  30.98 
 
 
1417 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  28.28 
 
 
1417 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  28.28 
 
 
830 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  27.52 
 
 
2367 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  27.52 
 
 
2358 aa  57  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  27.52 
 
 
2383 aa  57  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  25.61 
 
 
5337 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  30.49 
 
 
1396 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  28.42 
 
 
2933 aa  51.2  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  37.84 
 
 
811 aa  51.2  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  27.05 
 
 
1417 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  29.48 
 
 
2933 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  25.48 
 
 
535 aa  50.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  28.43 
 
 
821 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.97 
 
 
1084 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  26.55 
 
 
1075 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  26.55 
 
 
1075 aa  47.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  26.55 
 
 
1050 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  27.42 
 
 
826 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  25.17 
 
 
1418 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>