12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0553 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
1002 aa  2031    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0127  von Willebrand factor, type A  28.84 
 
 
1081 aa  343  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  23.3 
 
 
892 aa  92.4  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  27.72 
 
 
4953 aa  48.5  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  24.69 
 
 
614 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  25.06 
 
 
2383 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  25.18 
 
 
2358 aa  47  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  25.39 
 
 
2795 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  25.06 
 
 
2367 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
1437 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  26.94 
 
 
1746 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  30.85 
 
 
670 aa  45.8  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>