24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2415 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1052    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  41.3 
 
 		 299 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  43.07 
 
 		 324 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  42.12 
 
 		 316 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  44.7 
 
 		 408 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  44.7 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  40.51 
 
 		 312 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  41.38 
 
 		 309 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  40.61 
 
 		 309 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  38.26 
 
 		 309 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  37.02 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  27.78 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  26.49 
 
 		 1746 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  28.4 
 
 		 2358 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  28.4 
 
 		 2358 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  28.4 
 
 		 2367 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  28.4 
 
 		 2383 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  24.83 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  27.81 
 
 		 2296 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  27.81 
 
 		 2620 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  27.27 
 
 		 4953 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  26.87 
 
 		 1075 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  26.87 
 
 		 1075 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  27.44 
 
 		 2933 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>