23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  855    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  95.1 
 
 		 408 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  36.6 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  42.61 
 
 		 299 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  45.63 
 
 		 507 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  42.16 
 
 		 324 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  41.89 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  39.31 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  38.27 
 
 		 309 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  35.78 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  31.94 
 
 		 302 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  32 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  26.03 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2508  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580847  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0098  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.095292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0638  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101477  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0658  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.235003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0645  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0810  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10485  hypothetical protein  39.58 
 
 		 148 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.244525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0983  Protein of unknown function DUF2599  35.16 
 
 		 165 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.413748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2923  Protein of unknown function DUF2599  46.34 
 
 		 256 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.152404  normal  0.6472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34850  Protein of unknown function (DUF2599)  33.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>