24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3370 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  852    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  95.1 
 
 
408 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  36.52 
 
 
431 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  44.7 
 
 
507 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  41.58 
 
 
299 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  41.13 
 
 
324 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  41.89 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  38.27 
 
 
309 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  38.71 
 
 
316 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  35.78 
 
 
312 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  31.94 
 
 
302 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  33.33 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  26.67 
 
 
558 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2508  hypothetical protein  34.55 
 
 
141 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580847  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0098  hypothetical protein  31.82 
 
 
136 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.095292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0645  hypothetical protein  31.82 
 
 
138 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0658  hypothetical protein  31.82 
 
 
138 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.235003  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0638  hypothetical protein  30.91 
 
 
138 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101477  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0810  hypothetical protein  32.73 
 
 
136 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0983  Protein of unknown function DUF2599  32.97 
 
 
165 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.413748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2923  Protein of unknown function DUF2599  48.78 
 
 
256 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.152404  normal  0.6472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10485  hypothetical protein  39.58 
 
 
148 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.244525  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34850  Protein of unknown function (DUF2599)  29.51 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2237  hypothetical protein  34.26 
 
 
153 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>