13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2758 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  100 
 
 
558 aa  1162    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  25.58 
 
 
408 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  26.67 
 
 
408 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  24.83 
 
 
431 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  31.1 
 
 
302 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  24.77 
 
 
309 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  23.92 
 
 
299 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  26.9 
 
 
324 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2508  hypothetical protein  37.8 
 
 
141 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580847  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  24.83 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  27.81 
 
 
309 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  24.06 
 
 
312 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  26.88 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>