15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2508 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2508  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  294  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580847  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  36.36 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  34.55 
 
 		 408 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  37.27 
 
 		 431 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34850  Protein of unknown function (DUF2599)  36.27 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  37.8 
 
 		 558 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2237  hypothetical protein  34.78 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10485  hypothetical protein  47.06 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.244525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1405  hypothetical protein  31.73 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2923  Protein of unknown function DUF2599  50 
 
 		 256 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.152404  normal  0.6472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2365  hypothetical protein  29.47 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.249441  normal  0.0990712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0638  hypothetical protein  31.68 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101477  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0645  hypothetical protein  46.51 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0658  hypothetical protein  46.51 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.235003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0098  hypothetical protein  44.19 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.095292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>