17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2759 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  902    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  36.52 
 
 
408 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  36.98 
 
 
408 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  33.68 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  33.79 
 
 
299 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  32.26 
 
 
302 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  32.04 
 
 
316 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  31.62 
 
 
309 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  30.72 
 
 
309 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  28.32 
 
 
507 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  30.24 
 
 
312 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  24.83 
 
 
558 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  30.72 
 
 
309 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2508  hypothetical protein  37.27 
 
 
141 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580847  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1405  hypothetical protein  29.29 
 
 
293 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10485  hypothetical protein  47.92 
 
 
148 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.244525  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34850  Protein of unknown function (DUF2599)  26.78 
 
 
303 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>