13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3885 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  41.3 
 
 		 507 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  44.91 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  44.78 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  43.8 
 
 		 408 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  41.58 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  41.8 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  39.93 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  38.87 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  40.88 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  41.92 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  33.79 
 
 		 431 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  23.92 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>