62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5117 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  100 
 
 
1005 aa  2032    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  41.15 
 
 
1785 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  37.48 
 
 
1752 aa  294  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  37.76 
 
 
556 aa  293  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  37.57 
 
 
1781 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  38.21 
 
 
1051 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  38.29 
 
 
1589 aa  281  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  37.48 
 
 
1627 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  34.85 
 
 
509 aa  272  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  36.4 
 
 
1838 aa  267  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  36.05 
 
 
1744 aa  257  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  35.57 
 
 
1728 aa  253  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  35.39 
 
 
2337 aa  251  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  36.19 
 
 
2135 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  32.17 
 
 
528 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  30.3 
 
 
1389 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  32.29 
 
 
542 aa  199  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  30.45 
 
 
522 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  31.53 
 
 
506 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  31.31 
 
 
1282 aa  188  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  31.2 
 
 
569 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  30.28 
 
 
458 aa  171  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  55.21 
 
 
430 aa  171  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  30.39 
 
 
553 aa  170  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  29.56 
 
 
584 aa  165  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  29.22 
 
 
565 aa  161  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  26.71 
 
 
514 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  29.4 
 
 
552 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  28.29 
 
 
448 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  32.29 
 
 
614 aa  138  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  27.68 
 
 
824 aa  134  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  27 
 
 
503 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  43.14 
 
 
631 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  28.86 
 
 
628 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23.9 
 
 
515 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  35.81 
 
 
523 aa  103  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  36.96 
 
 
642 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  26.85 
 
 
547 aa  97.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.02 
 
 
546 aa  97.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  31.82 
 
 
1009 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  25.61 
 
 
559 aa  89.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  40.71 
 
 
119 aa  79.7  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.08 
 
 
1066 aa  62.4  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  25.79 
 
 
717 aa  60.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  23.51 
 
 
765 aa  60.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  35 
 
 
2620 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  27.03 
 
 
753 aa  57.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  32.92 
 
 
2383 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  32.92 
 
 
2367 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  32.92 
 
 
2358 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  32.92 
 
 
2296 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  32.92 
 
 
2358 aa  56.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  22.65 
 
 
773 aa  55.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.08 
 
 
772 aa  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  22.79 
 
 
765 aa  51.2  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  23.98 
 
 
753 aa  49.7  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  21.38 
 
 
670 aa  48.5  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  21.67 
 
 
777 aa  48.5  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  44.62 
 
 
3689 aa  47.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  21.11 
 
 
757 aa  47  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0779  hypothetical protein  25.41 
 
 
191 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  21.21 
 
 
757 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>