22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2328 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  243  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  51.92 
 
 
1838 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  52.87 
 
 
631 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  48.45 
 
 
2337 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  46.53 
 
 
1785 aa  95.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  48.45 
 
 
1728 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  47.92 
 
 
1009 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  45.37 
 
 
1627 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  44.79 
 
 
1051 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  42.71 
 
 
1589 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  51.25 
 
 
642 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  42.2 
 
 
1282 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  47.19 
 
 
1781 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  39.32 
 
 
2135 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  44.12 
 
 
1752 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  41.75 
 
 
430 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  39.8 
 
 
824 aa  82  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  45.88 
 
 
1744 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  40.71 
 
 
1005 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  38.2 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  36.14 
 
 
1389 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.97 
 
 
1066 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>