35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0606 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  100 
 
 		 553 aa  1127    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  42.24 
 
 		 565 aa  320  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  38.28 
 
 		 528 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  37.1 
 
 		 552 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  34.45 
 
 		 556 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  33.46 
 
 		 584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  34.83 
 
 		 569 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  34.51 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  30.28 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  30.39 
 
 		 1005 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1785 aa  160  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  32.13 
 
 		 1838 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1589 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  27.57 
 
 		 522 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1781 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1744 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1752 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  27.6 
 
 		 542 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1627 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1051 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.98 
 
 		 2337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  28.77 
 
 		 2135 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  28.53 
 
 		 1728 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28.37 
 
 		 506 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  27.76 
 
 		 514 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1282 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  28.52 
 
 		 1389 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  24.49 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  25.97 
 
 		 614 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  30.11 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  25.07 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  22.88 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  21.51 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  23.59 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  21.99 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>