170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6410 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  49.34 
 
 		 1051 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  40.63 
 
 		 1589 aa  958    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  44.8 
 
 		 1785 aa  1105    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  100 
 
 		 1781 aa  3551    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  39.01 
 
 		 1389 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1627 aa  919    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  46.36 
 
 		 1838 aa  703    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  52.74 
 
 		 1728 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  51.87 
 
 		 2337 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  85.14 
 
 		 1752 aa  2895    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  39.87 
 
 		 1282 aa  615  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  43.08 
 
 		 2135 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  46.34 
 
 		 1744 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  33.62 
 
 		 824 aa  307  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  37.57 
 
 		 1005 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  41.34 
 
 		 1009 aa  241  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  32.63 
 
 		 556 aa  213  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  31.96 
 
 		 509 aa  192  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  31.79 
 
 		 522 aa  190  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.53 
 
 		 1066 aa  174  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  52.53 
 
 		 631 aa  159  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  27.78 
 
 		 528 aa  149  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  27.23 
 
 		 565 aa  145  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  27.61 
 
 		 542 aa  141  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.51 
 
 		 4978 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  31.29 
 
 		 553 aa  134  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  27.44 
 
 		 506 aa  132  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  28.02 
 
 		 514 aa  132  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1006 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  28.93 
 
 		 569 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  31.56 
 
 		 552 aa  124  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  47.59 
 
 		 523 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  43.23 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  41.07 
 
 		 642 aa  114  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  26.26 
 
 		 584 aa  112  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  35.32 
 
 		 614 aa  108  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  28.73 
 
 		 458 aa  108  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.05 
 
 		 3927 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.43 
 
 		 4848 aa  98.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  29.97 
 
 		 5769 aa  92.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  27.22 
 
 		 503 aa  91.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.56 
 
 		 5745 aa  90.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1512 aa  89  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  26.43 
 
 		 559 aa  87.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  28.21 
 
 		 547 aa  87  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  47.19 
 
 		 119 aa  85.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.44 
 
 		 448 aa  84.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  47.37 
 
 		 1712 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  26.46 
 
 		 1367 aa  84  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  44.44 
 
 		 663 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  55.13 
 
 		 16322 aa  82  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.59 
 
 		 1268 aa  81.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  43.52 
 
 		 1538 aa  80.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31.49 
 
 		 1269 aa  79.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  46.23 
 
 		 1597 aa  78.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.12 
 
 		 1236 aa  78.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.11 
 
 		 1269 aa  77.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  27.64 
 
 		 628 aa  75.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.14 
 
 		 2346 aa  74.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.95 
 
 		 982 aa  74.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  47 
 
 		 994 aa  73.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.21 
 
 		 3363 aa  73.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  25.67 
 
 		 2353 aa  73.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  32.39 
 
 		 515 aa  71.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  46 
 
 		 721 aa  70.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  44.9 
 
 		 1394 aa  68.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.35 
 
 		 4122 aa  67.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  39.6 
 
 		 653 aa  67  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  51.35 
 
 		 5444 aa  67  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.72 
 
 		 2114 aa  65.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  41.12 
 
 		 2767 aa  65.9  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  37.31 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  36.65 
 
 		 1502 aa  65.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  37.24 
 
 		 653 aa  64.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  26.26 
 
 		 892 aa  63.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1518 aa  63.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  24.5 
 
 		 2074 aa  62.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  45.71 
 
 		 1131 aa  62.8  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  39.58 
 
 		 1911 aa  62  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  39.58 
 
 		 3089 aa  62  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  39.8 
 
 		 2848 aa  61.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  40 
 
 		 1416 aa  62  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.36 
 
 		 2816 aa  61.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.23 
 
 		 546 aa  61.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.51 
 
 		 1867 aa  61.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1126 aa  60.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  44.44 
 
 		 814 aa  60.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  23.5 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 1215 aa  59.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  38.3 
 
 		 974 aa  58.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.57 
 
 		 850 aa  58.9  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1131 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 1215 aa  58.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 3816 aa  58.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 1215 aa  58.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  36.08 
 
 		 1410 aa  57.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  41.24 
 
 		 1141 aa  57.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  39.77 
 
 		 8321 aa  58.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  37.37 
 
 		 3477 aa  57.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  36.84 
 
 		 2839 aa  58.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>