146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1048 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  100 
 
 		 1126 aa  2264    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  47.89 
 
 		 1838 aa  125  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  46.76 
 
 		 2024 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  46.94 
 
 		 4379 aa  115  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  45.32 
 
 		 1025 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  51.08 
 
 		 1557 aa  108  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1933 aa  105  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  45.39 
 
 		 1013 aa  104  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  53.45 
 
 		 3834 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  37.43 
 
 		 1597 aa  96.3  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  38.82 
 
 		 2345 aa  85.9  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  37.75 
 
 		 4848 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.68 
 
 		 3977 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.81 
 
 		 2182 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.45 
 
 		 850 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  38.69 
 
 		 1289 aa  75.1  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  32.75 
 
 		 814 aa  75.1  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  27.74 
 
 		 1269 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.57 
 
 		 2346 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  27.08 
 
 		 1268 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  30.04 
 
 		 2461 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31.03 
 
 		 1269 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  37.96 
 
 		 5769 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  42.31 
 
 		 2767 aa  73.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 994 aa  72.8  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  44.23 
 
 		 3474 aa  72  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  31.69 
 
 		 1367 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.63 
 
 		 3089 aa  71.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.79 
 
 		 4978 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.36 
 
 		 721 aa  70.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  41.28 
 
 		 16322 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 		 3363 aa  69.3  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  37.82 
 
 		 892 aa  68.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  36 
 
 		 2816 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  38.52 
 
 		 2476 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  37.82 
 
 		 2522 aa  67.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.4 
 
 		 761 aa  67.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1538 aa  67.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1752 aa  67.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  43.24 
 
 		 3477 aa  66.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  37.86 
 
 		 1287 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  39.5 
 
 		 2503 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  38.66 
 
 		 3544 aa  65.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.66 
 
 		 3699 aa  64.7  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  39.62 
 
 		 4854 aa  64.7  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  34.81 
 
 		 1712 aa  64.7  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  33.85 
 
 		 663 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  38.61 
 
 		 3927 aa  64.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  32.06 
 
 		 1394 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  37.82 
 
 		 3699 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  32.77 
 
 		 1911 aa  62.4  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.03 
 
 		 5745 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  36.69 
 
 		 1502 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  28.25 
 
 		 2831 aa  62  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.39 
 
 		 1363 aa  61.6  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1781 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  40.54 
 
 		 536 aa  61.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.87 
 
 		 2114 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 		 1884 aa  60.1  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 3816 aa  60.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.37 
 
 		 1109 aa  60.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  37.66 
 
 		 1027 aa  59.7  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  32.37 
 
 		 8321 aa  59.3  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  33.79 
 
 		 1867 aa  58.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  37.65 
 
 		 8871 aa  58.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  40.82 
 
 		 2839 aa  58.9  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  32.52 
 
 		 2715 aa  58.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.66 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 982 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1066 aa  58.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  35.16 
 
 		 1022 aa  56.6  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.34 
 
 		 3396 aa  57.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  31.62 
 
 		 1141 aa  56.6  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  29.44 
 
 		 3619 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.29 
 
 		 4220 aa  56.2  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  29.29 
 
 		 2239 aa  56.2  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.38 
 
 		 2542 aa  56.2  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  41.94 
 
 		 492 aa  56.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.49 
 
 		 3608 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  42.86 
 
 		 6276 aa  55.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  29.84 
 
 		 3619 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.27 
 
 		 846 aa  55.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  39.39 
 
 		 563 aa  55.5  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  40 
 
 		 2353 aa  55.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1744 aa  55.1  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  41.05 
 
 		 556 aa  54.3  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  36.67 
 
 		 1554 aa  53.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.76 
 
 		 2377 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  37.14 
 
 		 653 aa  53.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  31.91 
 
 		 2848 aa  53.5  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  35.09 
 
 		 4896 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  35.87 
 
 		 539 aa  52.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  28.49 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1006 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  31.78 
 
 		 808 aa  52  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  36.84 
 
 		 886 aa  51.6  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 2961 aa  51.6  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  27.59 
 
 		 1321 aa  50.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  37.36 
 
 		 653 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  27.02 
 
 		 1771 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>