184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0223 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  55.53 
 
 		 2522 aa  1263    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.89 
 
 		 3816 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  100 
 
 		 1911 aa  3804    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  85.78 
 
 		 3089 aa  2097    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  36.28 
 
 		 2715 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  54.26 
 
 		 3544 aa  1316    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  40.13 
 
 		 2839 aa  783    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  53.99 
 
 		 3699 aa  1303    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  52.9 
 
 		 2503 aa  1365    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  52.44 
 
 		 2476 aa  1368    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  54.13 
 
 		 3699 aa  1297    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  39.58 
 
 		 2153 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  34.73 
 
 		 2670 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  70.63 
 
 		 2042 aa  349  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  40.19 
 
 		 3477 aa  341  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  38.83 
 
 		 1480 aa  337  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  58.38 
 
 		 2192 aa  301  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  34.05 
 
 		 2848 aa  260  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  34.83 
 
 		 1362 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  58.94 
 
 		 1143 aa  229  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.58 
 
 		 3278 aa  187  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1879 aa  139  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.86 
 
 		 850 aa  120  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  38.04 
 
 		 1597 aa  111  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  36.89 
 
 		 1367 aa  112  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.56 
 
 		 994 aa  109  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  37.82 
 
 		 892 aa  108  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  40.32 
 
 		 1502 aa  107  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 761 aa  107  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  40.31 
 
 		 1268 aa  103  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0168  hypothetical protein  53.75 
 
 		 135 aa  103  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0163  hypothetical protein  53.75 
 
 		 135 aa  103  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  42.08 
 
 		 814 aa  103  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  33.65 
 
 		 721 aa  100  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.56 
 
 		 2114 aa  99.8  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  36.76 
 
 		 1363 aa  99  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  39.15 
 
 		 1269 aa  98.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  37.68 
 
 		 1269 aa  96.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  38.78 
 
 		 4978 aa  96.3  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  37.21 
 
 		 5745 aa  94  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  57.14 
 
 		 1848 aa  93.2  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  36.13 
 
 		 3474 aa  92.8  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.96 
 
 		 3363 aa  92.8  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  38.54 
 
 		 2816 aa  92.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  32.4 
 
 		 1061 aa  89.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  35.45 
 
 		 1422 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 		 1215 aa  87.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 		 1215 aa  87.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  37.31 
 
 		 4848 aa  87  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  36.24 
 
 		 1550 aa  86.7  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  36.81 
 
 		 8321 aa  84.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  52.33 
 
 		 475 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.85 
 
 		 1884 aa  82.8  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 1408 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1066 aa  81.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 1410 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 1410 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.06 
 
 		 2377 aa  81.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 		 3927 aa  81.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  34.34 
 
 		 663 aa  80.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  29.89 
 
 		 2074 aa  80.1  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.09 
 
 		 3191 aa  79.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  35.59 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  31.63 
 
 		 1215 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  34.21 
 
 		 2555 aa  78.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.12 
 
 		 1628 aa  77.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  30.42 
 
 		 9585 aa  77.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.98 
 
 		 1215 aa  77  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  31.98 
 
 		 1215 aa  77  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.16 
 
 		 1712 aa  75.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.22 
 
 		 1750 aa  75.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1744 aa  75.5  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  42.48 
 
 		 891 aa  74.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  30.39 
 
 		 2084 aa  73.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  46.24 
 
 		 539 aa  73.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.14 
 
 		 2346 aa  73.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  42.54 
 
 		 1625 aa  73.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  37.59 
 
 		 2051 aa  73.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1512 aa  71.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.87 
 
 		 1706 aa  70.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2011 aa  70.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  27.15 
 
 		 2067 aa  70.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1416 aa  70.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.12 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  41.74 
 
 		 2042 aa  69.3  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  27.67 
 
 		 2767 aa  68.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  29.95 
 
 		 2052 aa  66.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.48 
 
 		 2353 aa  65.5  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  32.66 
 
 		 3911 aa  65.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  29.31 
 
 		 2056 aa  64.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  41.11 
 
 		 1394 aa  63.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  29.79 
 
 		 2039 aa  63.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  39.22 
 
 		 1022 aa  63.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  30.19 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  29.02 
 
 		 9867 aa  62.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.84 
 
 		 4220 aa  62.4  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1126 aa  62.4  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  27.05 
 
 		 991 aa  62.4  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.05 
 
 		 2507 aa  62  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.92 
 
 		 2927 aa  61.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>