130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0505 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  100 
 
 		 891 aa  1808    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  41.81 
 
 		 886 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  39.12 
 
 		 709 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  41.08 
 
 		 661 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  40.27 
 
 		 734 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  36.72 
 
 		 667 aa  412  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  34.2 
 
 		 742 aa  318  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1093 aa  299  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  33.81 
 
 		 1063 aa  283  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  34.98 
 
 		 886 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  30.24 
 
 		 852 aa  251  5e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  30.71 
 
 		 863 aa  161  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 994 aa  95.9  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.52 
 
 		 850 aa  94  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.8 
 
 		 761 aa  92  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.33 
 
 		 3089 aa  89.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  36.19 
 
 		 4848 aa  89.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  34.02 
 
 		 814 aa  88.6  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  23.09 
 
 		 1008 aa  82  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.9 
 
 		 2767 aa  81.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  32.91 
 
 		 1911 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.87 
 
 		 2114 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  42.34 
 
 		 2816 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  37.23 
 
 		 1597 aa  79.3  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  37.23 
 
 		 3191 aa  77.8  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  38.76 
 
 		 892 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.98 
 
 		 2839 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.62 
 
 		 1066 aa  75.1  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  23 
 
 		 998 aa  72.4  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  34.27 
 
 		 2074 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3477 aa  71.2  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.32 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.63 
 
 		 3474 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  31.56 
 
 		 715 aa  68.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.48 
 
 		 2522 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  36.15 
 
 		 4978 aa  67.8  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.76 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.39 
 
 		 3544 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  31.9 
 
 		 2153 aa  67.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.7 
 
 		 1884 aa  66.6  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  24.34 
 
 		 783 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.13 
 
 		 2503 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  30.91 
 
 		 1367 aa  65.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.03 
 
 		 3816 aa  66.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.99 
 
 		 2353 aa  66.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.54 
 
 		 2807 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 3699 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  32.52 
 
 		 3699 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  34.46 
 
 		 1363 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  36.29 
 
 		 2848 aa  62.4  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.09 
 
 		 3363 aa  62  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  32.62 
 
 		 2476 aa  61.6  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  34.73 
 
 		 994 aa  61.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.54 
 
 		 5745 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1744 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  33.74 
 
 		 1215 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  33.74 
 
 		 1215 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  36.64 
 
 		 1502 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.06 
 
 		 3927 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  45.12 
 
 		 1061 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.6 
 
 		 2715 aa  57.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  31.35 
 
 		 1269 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  34.01 
 
 		 5769 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  30.68 
 
 		 653 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.56 
 
 		 846 aa  57  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  37.4 
 
 		 1781 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  31.51 
 
 		 1725 aa  56.2  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  32.53 
 
 		 1867 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  40 
 
 		 663 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  37.14 
 
 		 16322 aa  55.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1126 aa  54.7  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  39.18 
 
 		 653 aa  54.7  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  32.74 
 
 		 653 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1752 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1538 aa  53.5  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.26 
 
 		 1712 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.09 
 
 		 2377 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  37.5 
 
 		 1022 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  31.91 
 
 		 5123 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.81 
 
 		 1268 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.11 
 
 		 1883 aa  52.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31.35 
 
 		 1269 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  32.08 
 
 		 2670 aa  52.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  32.61 
 
 		 2555 aa  52  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  27.74 
 
 		 2853 aa  52  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  26.16 
 
 		 1706 aa  50.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  31.43 
 
 		 6211 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  36.84 
 
 		 1394 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1006 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  32.09 
 
 		 8321 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.43 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  41.03 
 
 		 539 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  41.3 
 
 		 1027 aa  50.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  34.43 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.54 
 
 		 2768 aa  49.7  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  30.85 
 
 		 4791 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  32.64 
 
 		 5094 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.74 
 
 		 5839 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  35.04 
 
 		 4231 aa  48.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  34.43 
 
 		 1215 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>