29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05520 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  100 
 
 		 742 aa  1534    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  41.73 
 
 		 709 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  41.44 
 
 		 661 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1093 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  39.94 
 
 		 734 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  36.87 
 
 		 886 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  34.52 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  35.5 
 
 		 1063 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  33.84 
 
 		 891 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  32.84 
 
 		 886 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  28.48 
 
 		 852 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  32.12 
 
 		 863 aa  172  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  24.91 
 
 		 1008 aa  101  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  25.1 
 
 		 998 aa  80.5  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  21.25 
 
 		 783 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.27 
 
 		 1143 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  36.36 
 
 		 617 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.95 
 
 		 752 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  36.71 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  33.75 
 
 		 1048 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  34.04 
 
 		 984 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  27.63 
 
 		 749 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  34.62 
 
 		 748 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  30.11 
 
 		 654 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  28.4 
 
 		 707 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  27.27 
 
 		 461 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  27.5 
 
 		 549 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1243 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1204  hypothetical protein  24 
 
 		 782 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.980122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>