18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0966 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  67.76 
 
 
734 aa  953    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  68.53 
 
 
661 aa  918    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  100 
 
 
709 aa  1437    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  49.09 
 
 
667 aa  618  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  42.48 
 
 
886 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  41.3 
 
 
742 aa  462  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  38.82 
 
 
891 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  39.86 
 
 
1093 aa  425  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  41.38 
 
 
1063 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  35.95 
 
 
886 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  31.6 
 
 
852 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  33.33 
 
 
863 aa  212  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  25.62 
 
 
1008 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  25.65 
 
 
998 aa  81.6  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  23.17 
 
 
783 aa  79  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.38 
 
 
1143 aa  60.8  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.06 
 
 
848 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  51.16 
 
 
806 aa  44.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>