28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0359 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  100 
 
 		 1008 aa  2083    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  34.66 
 
 		 783 aa  316  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  32.34 
 
 		 998 aa  313  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  35.36 
 
 		 4071 aa  131  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  32.39 
 
 		 2833 aa  131  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  28.24 
 
 		 734 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  26.11 
 
 		 709 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  26.04 
 
 		 852 aa  101  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  26.94 
 
 		 661 aa  101  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  24.91 
 
 		 742 aa  101  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  26.37 
 
 		 886 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  26.27 
 
 		 667 aa  99.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  32.29 
 
 		 2588 aa  95.9  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0725  hypothetical protein  65 
 
 		 60 aa  86.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  28.21 
 
 		 1063 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  23.09 
 
 		 891 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1093 aa  70.5  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  26.46 
 
 		 3089 aa  67  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  28.72 
 
 		 2344 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  31.07 
 
 		 2602 aa  61.2  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1665 aa  57.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  22.65 
 
 		 886 aa  55.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  32.69 
 
 		 2267 aa  53.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  23.13 
 
 		 863 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2478 aa  49.3  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.72 
 
 		 3737 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  28.02 
 
 		 2487 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1461 aa  45.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>