16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4153 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  100 
 
 		 863 aa  1754    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  32.97 
 
 		 734 aa  221  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  33.26 
 
 		 661 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  34.07 
 
 		 709 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  34.87 
 
 		 1093 aa  203  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  31.69 
 
 		 667 aa  194  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  32.16 
 
 		 886 aa  184  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  32.12 
 
 		 742 aa  172  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  30.71 
 
 		 891 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  28.71 
 
 		 886 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  28.49 
 
 		 1063 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  28.65 
 
 		 852 aa  125  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  33.71 
 
 		 1008 aa  57  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.63 
 
 		 1143 aa  54.7  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  23.39 
 
 		 783 aa  46.2  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  37.35 
 
 		 665 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>