17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0728 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1378    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  49.16 
 
 
661 aa  625  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  49.09 
 
 
709 aa  618  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  46.74 
 
 
734 aa  581  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  42.52 
 
 
886 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  36.72 
 
 
891 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  36.96 
 
 
1093 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  34.52 
 
 
742 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  36.01 
 
 
1063 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  33.33 
 
 
886 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  34.4 
 
 
852 aa  284  4.0000000000000003e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  33.74 
 
 
863 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  26.13 
 
 
998 aa  100  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  26.74 
 
 
1008 aa  99.4  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  23.28 
 
 
783 aa  77.4  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.63 
 
 
1143 aa  47.8  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  24.51 
 
 
460 aa  47.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>