94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13263 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  100 
 
 
1093 aa  2234    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  40.29 
 
 
742 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  40.36 
 
 
709 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  36.96 
 
 
667 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  37.39 
 
 
661 aa  386  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  37.58 
 
 
734 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  36.4 
 
 
886 aa  349  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  32.45 
 
 
1063 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  36.28 
 
 
886 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  33.18 
 
 
852 aa  317  7e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  34.53 
 
 
891 aa  297  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  35.63 
 
 
863 aa  202  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  34.1 
 
 
868 aa  112  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  37.07 
 
 
644 aa  74.7  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  35.71 
 
 
840 aa  72  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.07 
 
 
3299 aa  71.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
775 aa  71.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  24.37 
 
 
1008 aa  71.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
835 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.68 
 
 
3419 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.88 
 
 
835 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  30.87 
 
 
818 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.89 
 
 
835 aa  67.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0345  proprotein convertase P  33.33 
 
 
693 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.21 
 
 
3537 aa  65.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.4 
 
 
836 aa  65.1  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  38.46 
 
 
1141 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.61 
 
 
3535 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  30.22 
 
 
1151 aa  62.4  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2210  proprotein convertase, P  30.83 
 
 
403 aa  61.2  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.163258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  25.62 
 
 
998 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  37.89 
 
 
365 aa  59.3  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.36 
 
 
514 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
662 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  32.61 
 
 
1147 aa  55.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  25.9 
 
 
659 aa  55.1  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  38.16 
 
 
654 aa  54.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  30.48 
 
 
1441 aa  53.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0343  proprotein convertase P  27.46 
 
 
730 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000557566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.04 
 
 
807 aa  53.5  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  29.31 
 
 
677 aa  52  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  34.21 
 
 
887 aa  52  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.98 
 
 
724 aa  51.6  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0344  peptidase domain-containing protein  27.27 
 
 
716 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.598712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.31 
 
 
3298 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  32.31 
 
 
356 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.07 
 
 
807 aa  50.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  35.96 
 
 
501 aa  49.3  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1999  Proprotein convertase P  31.25 
 
 
209 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.37 
 
 
1158 aa  48.9  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  48.9  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  40.54 
 
 
1154 aa  48.5  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  40.45 
 
 
935 aa  48.5  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3045  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.64 
 
 
703 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.54 
 
 
705 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  28.72 
 
 
884 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.97 
 
 
818 aa  48.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001597  putative extracellular serine protease  33.04 
 
 
592 aa  47.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  36.56 
 
 
560 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  27.97 
 
 
794 aa  48.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  34.83 
 
 
927 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  22.07 
 
 
938 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06765  hypothetical protein  31.11 
 
 
148 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05576  serine proteinase  30.63 
 
 
592 aa  47.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  32.1 
 
 
528 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  28.81 
 
 
803 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.97 
 
 
803 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.21 
 
 
703 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  32.88 
 
 
540 aa  46.2  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.93 
 
 
720 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05132  hypothetical protein  27.59 
 
 
400 aa  46.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  21.79 
 
 
783 aa  45.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001258  hypothetical protein  28.45 
 
 
749 aa  45.8  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  30.77 
 
 
461 aa  45.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  29.32 
 
 
984 aa  45.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0344  hypothetical protein  30.43 
 
 
880 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.36736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5215  hypothetical protein  33.68 
 
 
173 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  27.78 
 
 
662 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  35.94 
 
 
669 aa  45.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  36.49 
 
 
613 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  28.67 
 
 
2364 aa  45.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  29.36 
 
 
725 aa  45.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1610  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.15 
 
 
707 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 
819 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 
819 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2524  subtilisin-like serine protease  38.89 
 
 
1116 aa  45.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 
819 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 
819 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 
597 aa  45.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  26.52 
 
 
574 aa  44.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  24.75 
 
 
757 aa  44.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  28.03 
 
 
744 aa  44.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  28.75 
 
 
1449 aa  44.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6580  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 
519 aa  44.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>