20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0358 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  100 
 
 		 783 aa  1630    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  36.39 
 
 		 998 aa  333  6e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  34.66 
 
 		 1008 aa  317  7e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  24.84 
 
 		 852 aa  79.7  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  23.17 
 
 		 709 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  23.28 
 
 		 667 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0725  hypothetical protein  65 
 
 		 60 aa  76.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  23.82 
 
 		 886 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  24.51 
 
 		 734 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  25.86 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  26.38 
 
 		 891 aa  65.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  25.28 
 
 		 886 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  21.46 
 
 		 742 aa  59.3  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  31.25 
 
 		 2602 aa  48.1  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  23.39 
 
 		 863 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  33.68 
 
 		 2267 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  30.22 
 
 		 1063 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  42.03 
 
 		 3191 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1093 aa  44.3  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  35.94 
 
 		 231 aa  44.3  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>