20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0357 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  100 
 
 		 998 aa  2085    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  36.39 
 
 		 783 aa  333  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  32.34 
 
 		 1008 aa  313  7.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  26.72 
 
 		 852 aa  108  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  26.13 
 
 		 667 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  25.55 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  27.03 
 
 		 2833 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  25.1 
 
 		 742 aa  79.7  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  28.11 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0725  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  74.7  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  25.71 
 
 		 734 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  26.78 
 
 		 4071 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  25.18 
 
 		 891 aa  70.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  22.48 
 
 		 886 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1093 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 		 2588 aa  58.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  22.43 
 
 		 886 aa  55.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  32.65 
 
 		 2602 aa  51.2  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1665 aa  51.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  32.32 
 
 		 863 aa  44.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>