72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0590 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  100 
 
 		 665 aa  1192    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  91.47 
 
 		 665 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5023  PE-PGRS family protein  42.11 
 
 		 636 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0598462  normal  0.091778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  35.14 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  39.58 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  41.03 
 
 		 1750 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.96 
 
 		 1217 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  42.06 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.73 
 
 		 1212 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  43.97 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  42.03 
 
 		 1376 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  37.04 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  51.19 
 
 		 833 aa  61.6  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  47.57 
 
 		 848 aa  61.6  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  39.25 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  46.81 
 
 		 1022 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  42.11 
 
 		 1004 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  40.52 
 
 		 869 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 868 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  39.13 
 
 		 867 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  35.87 
 
 		 868 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  37.37 
 
 		 1084 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  39.13 
 
 		 868 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  34.34 
 
 		 1686 aa  55.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  36.44 
 
 		 1140 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  49.47 
 
 		 848 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  34.31 
 
 		 1627 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  42.16 
 
 		 595 aa  54.7  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  46.88 
 
 		 855 aa  54.7  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  35.95 
 
 		 746 aa  54.3  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  43.9 
 
 		 460 aa  54.7  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  35.87 
 
 		 868 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 		 868 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.87 
 
 		 868 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  32.73 
 
 		 985 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.98 
 
 		 1762 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  45.54 
 
 		 634 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  42.55 
 
 		 1011 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  40.91 
 
 		 685 aa  51.2  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1208 aa  51.2  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  40 
 
 		 1590 aa  50.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  41.3 
 
 		 1011 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  27.62 
 
 		 1418 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  33.9 
 
 		 2178 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.62 
 
 		 2002 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.33 
 
 		 600 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.5 
 
 		 4761 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  43 
 
 		 1589 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  36.67 
 
 		 994 aa  48.5  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  40.21 
 
 		 1608 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  38.61 
 
 		 1771 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  38.1 
 
 		 950 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  34.74 
 
 		 528 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  37.11 
 
 		 1265 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  41.35 
 
 		 635 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  41.12 
 
 		 536 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.25 
 
 		 2002 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 		 863 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.29 
 
 		 1293 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  39 
 
 		 1627 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  38.26 
 
 		 648 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  36.54 
 
 		 577 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  41.35 
 
 		 635 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  47.37 
 
 		 994 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  33.85 
 
 		 972 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  45.9 
 
 		 3925 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  41.3 
 
 		 2706 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1785 aa  44.3  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  34 
 
 		 826 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.79 
 
 		 1212 aa  44.3  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.75 
 
 		 3197 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  38.89 
 
 		 824 aa  43.9  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>