154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2974 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 833 aa  1682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  42.56 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  37.72 
 
 		 489 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  39.15 
 
 		 1107 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.69 
 
 		 1750 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  36.22 
 
 		 386 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  40.41 
 
 		 433 aa  124  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  40.27 
 
 		 353 aa  124  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  35.29 
 
 		 389 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  37.78 
 
 		 344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  39.02 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  40.2 
 
 		 349 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  36.42 
 
 		 1011 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  36.08 
 
 		 392 aa  112  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  35.03 
 
 		 635 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.3 
 
 		 1217 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.5 
 
 		 1212 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  38.76 
 
 		 972 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  33.63 
 
 		 1376 aa  101  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  40.31 
 
 		 635 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  40.09 
 
 		 288 aa  97.8  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  34.25 
 
 		 634 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  42.27 
 
 		 1022 aa  95.5  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.5 
 
 		 868 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  38.93 
 
 		 391 aa  95.1  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  35.98 
 
 		 260 aa  94.4  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  35.24 
 
 		 1771 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  35.16 
 
 		 868 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  37.5 
 
 		 706 aa  93.2  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  37.9 
 
 		 867 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  38.12 
 
 		 868 aa  92  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  34.39 
 
 		 869 aa  91.3  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  36.13 
 
 		 1393 aa  91.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.7 
 
 		 868 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  37.44 
 
 		 868 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  37.22 
 
 		 868 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  36.65 
 
 		 1393 aa  87.8  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  29.74 
 
 		 516 aa  87.4  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  34.93 
 
 		 384 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  34.6 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  37.69 
 
 		 855 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 		 863 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  36.54 
 
 		 848 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  33.81 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  35.23 
 
 		 861 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.85 
 
 		 3278 aa  80.1  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  33.63 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  37.69 
 
 		 848 aa  78.6  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  31.53 
 
 		 326 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  30 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  42.99 
 
 		 1098 aa  71.2  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  46.32 
 
 		 994 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  27.31 
 
 		 985 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  32.16 
 
 		 950 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  45.92 
 
 		 746 aa  68.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  29.32 
 
 		 571 aa  67.4  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  28.25 
 
 		 2169 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  34.25 
 
 		 264 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  50.57 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  36.76 
 
 		 1220 aa  64.3  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  30.82 
 
 		 312 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.09 
 
 		 911 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  35 
 
 		 902 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  53.66 
 
 		 665 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  26.48 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.16 
 
 		 1212 aa  62.4  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  40.82 
 
 		 1258 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  32.2 
 
 		 994 aa  61.6  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 		 1283 aa  61.6  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  43.56 
 
 		 1011 aa  61.6  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  36.53 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  37.14 
 
 		 587 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1608 aa  60.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  40.51 
 
 		 450 aa  60.1  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  35.43 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  33.71 
 
 		 294 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1100 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  37.14 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  37.14 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  37.14 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  35.46 
 
 		 820 aa  59.3  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  32.22 
 
 		 901 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  28.52 
 
 		 591 aa  58.9  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  42.55 
 
 		 1418 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  33.8 
 
 		 873 aa  58.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  37.69 
 
 		 1739 aa  58.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.14 
 
 		 3197 aa  58.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  40.16 
 
 		 969 aa  57.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.06 
 
 		 913 aa  58.2  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  31.27 
 
 		 1084 aa  57.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  44.58 
 
 		 1004 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  27.18 
 
 		 1204 aa  57.4  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1208 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  27.72 
 
 		 1631 aa  56.2  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1416 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.03 
 
 		 1293 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.62 
 
 		 792 aa  55.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  41.76 
 
 		 498 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  36.28 
 
 		 1265 aa  55.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>