167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2254 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 1011 aa  1936    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  36.47 
 
 		 1771 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  39.24 
 
 		 1376 aa  258  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  30.93 
 
 		 3927 aa  194  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  41.79 
 
 		 635 aa  190  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  39.94 
 
 		 634 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  40.25 
 
 		 635 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1022 aa  168  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  31.57 
 
 		 506 aa  159  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  48.68 
 
 		 706 aa  141  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  30.12 
 
 		 2074 aa  124  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.33 
 
 		 1107 aa  118  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.21 
 
 		 994 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  36.97 
 
 		 833 aa  111  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.22 
 
 		 1750 aa  111  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.75 
 
 		 1212 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3452  hypothetical protein  31.55 
 
 		 719 aa  102  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153341  normal  0.241088 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  26.71 
 
 		 1057 aa  100  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.45 
 
 		 3197 aa  99.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.99 
 
 		 1217 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.99 
 
 		 3197 aa  93.2  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  30.08 
 
 		 1204 aa  93.2  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1512 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  46.67 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  38.5 
 
 		 868 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.32 
 
 		 1565 aa  84.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  47.13 
 
 		 835 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  37.97 
 
 		 868 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 		 868 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  50 
 
 		 1004 aa  82  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  38.5 
 
 		 867 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  33.69 
 
 		 869 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  33.99 
 
 		 972 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.91 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  31.84 
 
 		 985 aa  75.5  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  30.41 
 
 		 873 aa  74.7  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.21 
 
 		 892 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  31.82 
 
 		 855 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.94 
 
 		 2272 aa  72.8  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.53 
 
 		 850 aa  72.8  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  29.12 
 
 		 861 aa  72  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  26.37 
 
 		 2377 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  35.26 
 
 		 868 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  32.26 
 
 		 868 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  33.68 
 
 		 848 aa  69.7  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.03 
 
 		 1884 aa  68.9  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 		 863 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  31.94 
 
 		 868 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  33.86 
 
 		 848 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  29.61 
 
 		 1098 aa  66.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.89 
 
 		 816 aa  66.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  28.87 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  32.08 
 
 		 1084 aa  64.7  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  26.65 
 
 		 2554 aa  63.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  42.53 
 
 		 1601 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1682 aa  61.6  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.38 
 
 		 11716 aa  61.6  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.83 
 
 		 1779 aa  61.6  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1916 aa  61.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  33.17 
 
 		 1150 aa  60.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  31.05 
 
 		 792 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  32.95 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  35.29 
 
 		 712 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  29.22 
 
 		 1421 aa  57.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.12 
 
 		 1389 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.86 
 
 		 3793 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  30.57 
 
 		 3278 aa  57  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  45.57 
 
 		 994 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.98 
 
 		 1597 aa  55.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  33.68 
 
 		 1393 aa  55.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  24.86 
 
 		 1361 aa  55.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 400 aa  55.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  43.18 
 
 		 665 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  27.89 
 
 		 623 aa  55.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  24.5 
 
 		 3602 aa  55.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  36.89 
 
 		 1143 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0860  hypothetical protein  31.65 
 
 		 956 aa  55.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  27.69 
 
 		 1029 aa  55.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  38.05 
 
 		 969 aa  54.7  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  25.65 
 
 		 978 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 761 aa  54.3  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  30.5 
 
 		 3244 aa  54.3  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.71 
 
 		 2839 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.99 
 
 		 2507 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1432  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1175 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.974994  normal  0.889797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1608 aa  53.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  25.52 
 
 		 1371 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  26.65 
 
 		 1236 aa  52.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0603  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1090 aa  52  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.14 
 
 		 1862 aa  52  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  24.93 
 
 		 517 aa  51.6  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.87 
 
 		 746 aa  51.6  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.15 
 
 		 2656 aa  51.2  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  40.65 
 
 		 587 aa  51.2  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  31.2 
 
 		 965 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  31.2 
 
 		 965 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  40.78 
 
 		 665 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  40.65 
 
 		 587 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  37.11 
 
 		 1258 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  40.34 
 
 		 553 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>