75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2572 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  44.78 
 
 		 1557 aa  883    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  100 
 
 		 1608 aa  3256    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2396  hypothetical protein  29.25 
 
 		 616 aa  195  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000510296 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0954  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1354 aa  116  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000910199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  27.01 
 
 		 2528 aa  107  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  21.4 
 
 		 2474 aa  82.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  26.39 
 
 		 1951 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.36 
 
 		 5743 aa  79.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.56 
 
 		 1024 aa  63.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  33.87 
 
 		 307 aa  60.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.78 
 
 		 833 aa  60.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  29.33 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  24.56 
 
 		 831 aa  58.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  24.83 
 
 		 668 aa  57.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  39.18 
 
 		 969 aa  57  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3634  hypothetical protein  41.86 
 
 		 482 aa  56.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  hitchhiker  0.000640384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  34.87 
 
 		 635 aa  56.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 621 aa  56.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  45.45 
 
 		 634 aa  55.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  23.65 
 
 		 290 aa  55.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  34.87 
 
 		 635 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  39.18 
 
 		 665 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  24.51 
 
 		 392 aa  53.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2017  hypothetical protein  28.67 
 
 		 593 aa  53.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  28.49 
 
 		 353 aa  53.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  26.07 
 
 		 689 aa  52.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  28.44 
 
 		 1011 aa  53.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  38.14 
 
 		 665 aa  52.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  22.83 
 
 		 588 aa  52.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  23.74 
 
 		 1084 aa  52.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.1 
 
 		 930 aa  52.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  24.89 
 
 		 326 aa  52.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  35.61 
 
 		 706 aa  51.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  24.82 
 
 		 1397 aa  51.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  25.51 
 
 		 627 aa  50.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  24.88 
 
 		 927 aa  50.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.3 
 
 		 930 aa  50.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.79 
 
 		 1054 aa  48.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.03 
 
 		 676 aa  48.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  31.2 
 
 		 1355 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  24.29 
 
 		 387 aa  48.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4148  squalene-hopene cyclase  26.43 
 
 		 669 aa  48.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146424  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1678  hypothetical protein  40.79 
 
 		 940 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507171  hitchhiker  0.000632186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1146 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  35.56 
 
 		 709 aa  47.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.37 
 
 		 522 aa  47.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3360  squalene-hopene cyclase  34.23 
 
 		 680 aa  47.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0001243  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  21.4 
 
 		 351 aa  47.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  26.51 
 
 		 677 aa  47.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  21.17 
 
 		 331 aa  47.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0162  hypothetical protein  27.44 
 
 		 269 aa  47.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  22 
 
 		 1378 aa  47  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  21.85 
 
 		 1414 aa  47.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  32.38 
 
 		 884 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  26.5 
 
 		 460 aa  47  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1163 aa  47  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.83 
 
 		 1534 aa  46.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1022 aa  46.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.61 
 
 		 343 aa  46.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  44.83 
 
 		 950 aa  46.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.79 
 
 		 289 aa  46.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0885  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 680 aa  46.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000419297 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  20.47 
 
 		 525 aa  46.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  23.04 
 
 		 651 aa  45.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  26.42 
 
 		 1404 aa  45.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  23.04 
 
 		 651 aa  45.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0316  hypothetical protein  23.93 
 
 		 439 aa  45.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  23.04 
 
 		 657 aa  45.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  23.04 
 
 		 657 aa  45.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  23.04 
 
 		 657 aa  45.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  23.04 
 
 		 657 aa  45.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  23.04 
 
 		 657 aa  45.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  22.03 
 
 		 335 aa  45.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  26.75 
 
 		 657 aa  45.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2359  squalene-hopene cyclase  23.04 
 
 		 657 aa  45.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>