260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2764 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  100 
 
 
1084 aa  2144    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1738  hypothetical protein  44.53 
 
 
800 aa  309  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.761687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2309  hypothetical protein  37.5 
 
 
501 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2315  hypothetical protein  30.42 
 
 
573 aa  146  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101982  normal  0.971281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  34.09 
 
 
1771 aa  125  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  32.49 
 
 
1011 aa  124  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.85 
 
 
1212 aa  118  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  47.59 
 
 
623 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  30.88 
 
 
1107 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  47.9 
 
 
816 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.97 
 
 
1217 aa  113  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.58 
 
 
1750 aa  110  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  31.46 
 
 
1057 aa  105  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  38.5 
 
 
734 aa  105  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  32.89 
 
 
820 aa  101  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.17 
 
 
1565 aa  95.1  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.94 
 
 
3197 aa  91.7  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.31 
 
 
3197 aa  89  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  31.96 
 
 
833 aa  85.5  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  30.22 
 
 
1376 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  33.59 
 
 
635 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  45.74 
 
 
861 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  37.1 
 
 
792 aa  79  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  33.68 
 
 
855 aa  79  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  36.63 
 
 
873 aa  77.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  35.4 
 
 
1916 aa  77  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  46.34 
 
 
943 aa  76.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  30.31 
 
 
634 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  41.92 
 
 
1150 aa  75.1  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  35.12 
 
 
635 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  36.81 
 
 
848 aa  74.7  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  43.43 
 
 
1104 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  43.43 
 
 
1104 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  29.7 
 
 
552 aa  73.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  50 
 
 
2066 aa  72.4  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  46.67 
 
 
634 aa  72.4  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  33.98 
 
 
972 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.83 
 
 
639 aa  71.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2147  PKD domain containing protein  36.05 
 
 
1556 aa  71.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.927191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  44.9 
 
 
1601 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  30.72 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.88 
 
 
2272 aa  68.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.47 
 
 
848 aa  67.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  39.39 
 
 
1022 aa  67.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.52 
 
 
6885 aa  67  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.03 
 
 
596 aa  67.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  30.94 
 
 
1814 aa  66.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.67 
 
 
942 aa  66.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  47.19 
 
 
780 aa  66.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  28.06 
 
 
571 aa  64.7  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  35.22 
 
 
2176 aa  64.7  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  36.36 
 
 
840 aa  64.7  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
1667 aa  64.3  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  38.1 
 
 
944 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  41.05 
 
 
1011 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  40.78 
 
 
978 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  36.13 
 
 
1682 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  37.3 
 
 
944 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  37.3 
 
 
944 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  40.66 
 
 
563 aa  62.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  28.12 
 
 
951 aa  62.4  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  39.81 
 
 
2000 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  37.3 
 
 
944 aa  62.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  38.61 
 
 
677 aa  62.4  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.2 
 
 
601 aa  62.4  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  47.69 
 
 
386 aa  62.4  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  36.02 
 
 
995 aa  62.4  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  41.58 
 
 
712 aa  62.4  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  35.4 
 
 
746 aa  62.4  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.85 
 
 
868 aa  62  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  43.82 
 
 
713 aa  62  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  36.3 
 
 
775 aa  62  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  32.4 
 
 
1027 aa  62  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.96 
 
 
955 aa  62  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  37.59 
 
 
1084 aa  61.6  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  32.49 
 
 
918 aa  62  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  27.27 
 
 
506 aa  61.6  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  46.59 
 
 
823 aa  61.6  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3153  hypothetical protein  35.34 
 
 
285 aa  60.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.71 
 
 
1158 aa  60.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  31.01 
 
 
591 aa  60.1  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  39.56 
 
 
971 aa  60.1  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  35.71 
 
 
575 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  55.93 
 
 
884 aa  59.7  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  32.74 
 
 
917 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  33.55 
 
 
1292 aa  59.7  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  36.96 
 
 
541 aa  59.3  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.51 
 
 
944 aa  58.9  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  26.7 
 
 
1162 aa  58.9  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  38.46 
 
 
967 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.95 
 
 
773 aa  58.9  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  40.71 
 
 
1367 aa  58.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  33.33 
 
 
945 aa  58.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4630  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.53 
 
 
1405 aa  58.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  50.63 
 
 
461 aa  57.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  31.92 
 
 
706 aa  57.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.64 
 
 
406 aa  57.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  33.33 
 
 
777 aa  57.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  44.83 
 
 
521 aa  57.4  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  30.96 
 
 
868 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>