More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1644 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  100 
 
 
820 aa  1646    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2148  hypothetical protein  26.87 
 
 
532 aa  148  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.39 
 
 
623 aa  91.3  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
1565 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  24.29 
 
 
1376 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  35.08 
 
 
816 aa  81.3  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  35.94 
 
 
792 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  35.96 
 
 
1057 aa  76.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  30.56 
 
 
1107 aa  76.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  34.76 
 
 
972 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  42.59 
 
 
938 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.14 
 
 
773 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  35.48 
 
 
1667 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  34.59 
 
 
1150 aa  73.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  35.26 
 
 
869 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  38.94 
 
 
777 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  38.02 
 
 
552 aa  71.6  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  45.71 
 
 
1151 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.89 
 
 
639 aa  71.2  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  34.59 
 
 
868 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  41.44 
 
 
938 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  24.87 
 
 
777 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  32.66 
 
 
855 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  39.58 
 
 
840 aa  70.1  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  30.26 
 
 
971 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  30.74 
 
 
867 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  32.81 
 
 
965 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.05 
 
 
1158 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  40 
 
 
951 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  29.8 
 
 
868 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  41.38 
 
 
780 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 
868 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  29.29 
 
 
778 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 
868 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  29.29 
 
 
778 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  29.29 
 
 
778 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  38.26 
 
 
1292 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.93 
 
 
596 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  38.79 
 
 
1601 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  32.03 
 
 
965 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.67 
 
 
1783 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  29.29 
 
 
778 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  39.8 
 
 
1027 aa  66.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  30.66 
 
 
971 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  33.51 
 
 
868 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  38.1 
 
 
861 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  46.58 
 
 
884 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  35.45 
 
 
818 aa  65.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  31.45 
 
 
1104 aa  65.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  31.45 
 
 
1104 aa  65.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  32.45 
 
 
873 aa  65.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.29 
 
 
836 aa  65.1  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.22 
 
 
953 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  33.51 
 
 
868 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  47.22 
 
 
712 aa  64.7  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  30.47 
 
 
965 aa  64.3  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  31.01 
 
 
967 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  36.52 
 
 
677 aa  64.3  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  30.47 
 
 
965 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  31.25 
 
 
965 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  31.25 
 
 
965 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  41.35 
 
 
826 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  39.76 
 
 
965 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  39.76 
 
 
965 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.38 
 
 
699 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  39.76 
 
 
965 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  33.83 
 
 
1463 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  30.66 
 
 
971 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  46.03 
 
 
1018 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  34.57 
 
 
848 aa  62.4  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  41.98 
 
 
713 aa  62  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  37.29 
 
 
910 aa  62  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  36.36 
 
 
902 aa  62  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  35.46 
 
 
833 aa  61.6  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  35.34 
 
 
971 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  39.39 
 
 
2122 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  44.44 
 
 
971 aa  61.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  39.29 
 
 
669 aa  61.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  44.44 
 
 
971 aa  61.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  40.96 
 
 
460 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  44.44 
 
 
971 aa  61.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  30.47 
 
 
965 aa  61.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  44.93 
 
 
814 aa  61.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  44.44 
 
 
971 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  39.58 
 
 
1029 aa  60.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  29.92 
 
 
960 aa  60.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.75 
 
 
930 aa  60.8  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.25 
 
 
3295 aa  60.8  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  29.92 
 
 
960 aa  60.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  34.12 
 
 
935 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  33.64 
 
 
517 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.21 
 
 
1200 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  33.87 
 
 
1084 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  33.62 
 
 
971 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
835 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  35.59 
 
 
752 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.08 
 
 
1361 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  39.51 
 
 
3197 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  34.43 
 
 
1732 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.63 
 
 
835 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>