138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1399 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  100 
 
 
669 aa  1263    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3903  PKD domain containing protein  35.11 
 
 
644 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2716  PKD domain containing protein  35.86 
 
 
664 aa  181  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575961  normal  0.0544825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.25 
 
 
623 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  39.29 
 
 
820 aa  61.6  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  37.78 
 
 
873 aa  61.6  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  45.78 
 
 
1057 aa  62  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  40.7 
 
 
861 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  41.18 
 
 
884 aa  60.8  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  43.24 
 
 
943 aa  60.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  39.6 
 
 
712 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.54 
 
 
940 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  43.66 
 
 
816 aa  57.4  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  40 
 
 
713 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  47.14 
 
 
1050 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.62 
 
 
639 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  28.88 
 
 
2031 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  34.13 
 
 
552 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  35.58 
 
 
660 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  32.63 
 
 
677 aa  55.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.06 
 
 
3197 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.48 
 
 
3197 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  53.12 
 
 
386 aa  54.7  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  50 
 
 
734 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  30.63 
 
 
971 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.54 
 
 
601 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.3 
 
 
947 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  35.78 
 
 
823 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  36.25 
 
 
814 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  42.59 
 
 
721 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  47.69 
 
 
1150 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  34.04 
 
 
792 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.38 
 
 
942 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  35.16 
 
 
824 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  34.59 
 
 
517 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  36.05 
 
 
780 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  40.32 
 
 
778 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  40.91 
 
 
1565 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.07 
 
 
955 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  32.35 
 
 
965 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  36.08 
 
 
777 aa  51.2  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  32.35 
 
 
965 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  36.59 
 
 
840 aa  51.2  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  40.32 
 
 
778 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  40.32 
 
 
778 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  40.32 
 
 
778 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  33.78 
 
 
960 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  33.78 
 
 
960 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  33.33 
 
 
967 aa  50.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.14 
 
 
467 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  30.51 
 
 
948 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.75 
 
 
596 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  36.49 
 
 
1389 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  38.27 
 
 
1095 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 
948 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  31.37 
 
 
965 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  29.73 
 
 
971 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  31.52 
 
 
965 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  30.49 
 
 
1084 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  57.14 
 
 
948 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  40.3 
 
 
938 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  29.47 
 
 
2364 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  34.72 
 
 
1011 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  41.07 
 
 
948 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  37.14 
 
 
951 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1130  PKD domain containing protein  28.31 
 
 
514 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  35.06 
 
 
944 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  30.39 
 
 
965 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  35.06 
 
 
944 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  42.62 
 
 
317 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  27.93 
 
 
971 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  29.57 
 
 
944 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  27.12 
 
 
938 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 
1601 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.41 
 
 
699 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  38.04 
 
 
1667 aa  47.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  31.52 
 
 
965 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  38.1 
 
 
1018 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  30.43 
 
 
965 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  33.77 
 
 
944 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  29.41 
 
 
965 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  29.41 
 
 
965 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  41.18 
 
 
487 aa  47.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  42.31 
 
 
1916 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  29.41 
 
 
965 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  38.98 
 
 
1528 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.72 
 
 
439 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  30.49 
 
 
1104 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  30.49 
 
 
1104 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.55 
 
 
945 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
1158 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  37.5 
 
 
670 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  43.14 
 
 
774 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  37.38 
 
 
1309 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  36.51 
 
 
971 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  36.51 
 
 
971 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  39.68 
 
 
1367 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  26.28 
 
 
775 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  35.29 
 
 
1151 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  36.84 
 
 
1606 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>