More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0600 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  61.03 
 
 		 884 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  77.31 
 
 		 806 aa  949    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  100 
 
 		 712 aa  1460    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  59.09 
 
 		 1150 aa  92  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2808  cytochrome c family protein  39.73 
 
 		 189 aa  91.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000226609  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.12 
 
 		 639 aa  87.4  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  40.94 
 
 		 816 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  33.86 
 
 		 623 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  30.53 
 
 		 873 aa  84.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  43.85 
 
 		 969 aa  83.2  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  44.62 
 
 		 1565 aa  83.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  53.66 
 
 		 1916 aa  81.3  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  44.04 
 
 		 1057 aa  79.7  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  58.82 
 
 		 2066 aa  78.2  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  53.68 
 
 		 1771 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  48.35 
 
 		 780 aa  77.4  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  36.54 
 
 		 677 aa  77  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  44.71 
 
 		 967 aa  77  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  49.41 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  26.77 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  40.27 
 
 		 3197 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  46.43 
 
 		 792 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  36.05 
 
 		 943 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  38.89 
 
 		 1081 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  40.94 
 
 		 3197 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  26.52 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  26.52 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  43.48 
 
 		 861 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  41.76 
 
 		 971 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  53.25 
 
 		 563 aa  71.2  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  43.3 
 
 		 778 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  43.3 
 
 		 778 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  34.38 
 
 		 777 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  57.63 
 
 		 778 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.31 
 
 		 945 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  45.26 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.67 
 
 		 6885 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  41.86 
 
 		 814 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  33.7 
 
 		 965 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.28 
 
 		 953 aa  68.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  45.45 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  33.7 
 
 		 965 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  34.78 
 
 		 965 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  36.47 
 
 		 965 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  33.7 
 
 		 965 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  50.67 
 
 		 948 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  33.7 
 
 		 965 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  42.86 
 
 		 971 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  42.86 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  33.7 
 
 		 965 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  34.78 
 
 		 965 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  42.86 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  33.7 
 
 		 965 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  42.86 
 
 		 971 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  43.53 
 
 		 1084 aa  67  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  25.22 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  42.86 
 
 		 971 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  43.96 
 
 		 971 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.71 
 
 		 940 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  43.84 
 
 		 971 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  27.81 
 
 		 1050 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  50.55 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  33.7 
 
 		 965 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  52.54 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  25.15 
 
 		 658 aa  65.1  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  42.86 
 
 		 971 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  39.42 
 
 		 713 aa  64.3  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  38.82 
 
 		 775 aa  64.3  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  41.76 
 
 		 1018 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  47.22 
 
 		 820 aa  64.3  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  34.33 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  30.72 
 
 		 1027 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  44.9 
 
 		 848 aa  63.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2294  cytochrome c family protein  30.14 
 
 		 179 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  35.71 
 
 		 960 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  34.52 
 
 		 960 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  42.55 
 
 		 1151 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  23.41 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  50 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  26.27 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  35.71 
 
 		 960 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  23.79 
 
 		 757 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  47.89 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 942 aa  63.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  28.68 
 
 		 1104 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  33.33 
 
 		 1104 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.49 
 
 		 1200 aa  63.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  45.98 
 
 		 1135 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  48 
 
 		 944 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  51.28 
 
 		 461 aa  62  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  48 
 
 		 944 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  50.68 
 
 		 552 aa  62  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  48 
 
 		 944 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  25.58 
 
 		 790 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  42.5 
 
 		 1601 aa  61.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  51.85 
 
 		 774 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  46.67 
 
 		 944 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  44.74 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  23.33 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  40.43 
 
 		 972 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>