90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0845 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  100 
 
 
757 aa  1569    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  40.4 
 
 
658 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  28.83 
 
 
729 aa  250  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  31.63 
 
 
618 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  28.7 
 
 
615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  29.75 
 
 
619 aa  234  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  30.58 
 
 
616 aa  227  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  30.11 
 
 
616 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  30.3 
 
 
566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  30.18 
 
 
571 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  30.21 
 
 
618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  30.05 
 
 
566 aa  218  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  29.22 
 
 
577 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  26.34 
 
 
655 aa  204  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  25.74 
 
 
688 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  28.26 
 
 
670 aa  189  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  25.67 
 
 
662 aa  187  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  26.19 
 
 
689 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  24.67 
 
 
688 aa  164  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  34.72 
 
 
236 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  30.56 
 
 
346 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  30.56 
 
 
346 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  30.56 
 
 
346 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  29.43 
 
 
346 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.11 
 
 
247 aa  124  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  30.91 
 
 
241 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  30.91 
 
 
241 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  30.91 
 
 
241 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  26.26 
 
 
211 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  25.42 
 
 
471 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  25.78 
 
 
658 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.79 
 
 
712 aa  63.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  25.23 
 
 
646 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.41 
 
 
884 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  25.87 
 
 
658 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.21 
 
 
208 aa  55.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.21 
 
 
208 aa  55.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  25.4 
 
 
650 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.56 
 
 
208 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.56 
 
 
208 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.56 
 
 
208 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.56 
 
 
208 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.56 
 
 
208 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  25.86 
 
 
650 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  26.89 
 
 
304 aa  52.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  22.69 
 
 
487 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  26.2 
 
 
656 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  22.8 
 
 
711 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2098  formate dehydrogenase gamma subunit  28.95 
 
 
208 aa  51.2  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.976655  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.67 
 
 
208 aa  51.2  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3881  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.48 
 
 
208 aa  51.2  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208966  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3379  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.48 
 
 
208 aa  51.2  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  24.65 
 
 
307 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  24.32 
 
 
221 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  22.51 
 
 
442 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3542  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.95 
 
 
208 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0474806  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4595  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.85 
 
 
208 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473714  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  24.44 
 
 
427 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.19 
 
 
806 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  24.4 
 
 
315 aa  48.5  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1941  (Ni/Fe) hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.32 
 
 
186 aa  48.9  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  27.94 
 
 
363 aa  48.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.63 
 
 
426 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  27.63 
 
 
658 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  27.05 
 
 
458 aa  47.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3986  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.03 
 
 
208 aa  47.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4380  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.03 
 
 
208 aa  47.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212016  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6558  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.54 
 
 
218 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892588  hitchhiker  0.000719745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  25.45 
 
 
189 aa  47.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.96 
 
 
413 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  22.96 
 
 
883 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  24.43 
 
 
302 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  24.04 
 
 
881 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2349  hypothetical protein  28.46 
 
 
344 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  25 
 
 
589 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2551  formate dehydrogenase gamma subunit  24.07 
 
 
218 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233004  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  23.3 
 
 
317 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  22.28 
 
 
600 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  25.51 
 
 
307 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  23.23 
 
 
790 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  31.36 
 
 
270 aa  45.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.78 
 
 
227 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  25.52 
 
 
372 aa  45.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.12 
 
 
213 aa  45.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4520  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.17 
 
 
211 aa  45.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  25.48 
 
 
337 aa  44.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  24.78 
 
 
456 aa  44.3  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  26.06 
 
 
188 aa  44.3  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  26.76 
 
 
156 aa  43.9  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.12 
 
 
213 aa  43.9  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>