87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1541 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  100 
 
 		 656 aa  1334    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  38.62 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  32.65 
 
 		 790 aa  263  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  33.01 
 
 		 794 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  31.17 
 
 		 664 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  30.9 
 
 		 867 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  30.82 
 
 		 621 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  30.43 
 
 		 618 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  30.43 
 
 		 620 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  30.05 
 
 		 621 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  27.12 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  31.15 
 
 		 309 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  30.74 
 
 		 309 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  29.92 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  26.27 
 
 		 413 aa  102  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 312 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  27.65 
 
 		 265 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  30.07 
 
 		 279 aa  88.2  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  29.09 
 
 		 294 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  28.85 
 
 		 245 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  23.97 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  26.04 
 
 		 266 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  28.92 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  26.36 
 
 		 238 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  22.35 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  26.82 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  24.73 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  24.02 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  27.66 
 
 		 258 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  21.79 
 
 		 272 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.33 
 
 		 712 aa  60.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  23.32 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  22.93 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  27.53 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  27.87 
 
 		 329 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 333 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  27.87 
 
 		 329 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 333 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  27.87 
 
 		 329 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 333 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 333 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.43 
 
 		 884 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  27.55 
 
 		 299 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  22.35 
 
 		 658 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.35 
 
 		 806 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  23.59 
 
 		 487 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  24.28 
 
 		 658 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  22.97 
 
 		 656 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  25.64 
 
 		 334 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1110 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 958 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 958 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  21.9 
 
 		 711 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  23.78 
 
 		 717 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  23.68 
 
 		 646 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  27.83 
 
 		 266 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  26.59 
 
 		 329 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  27.2 
 
 		 329 aa  48.5  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  24.56 
 
 		 427 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  23.66 
 
 		 650 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  24.56 
 
 		 302 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  22.45 
 
 		 650 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  25 
 
 		 1106 aa  47.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  24.01 
 
 		 343 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  22.56 
 
 		 709 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  32.58 
 
 		 607 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  27.67 
 
 		 321 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  24.24 
 
 		 426 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  23.32 
 
 		 330 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  23.58 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  26.29 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  26.16 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  26.54 
 
 		 317 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  23.75 
 
 		 309 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  25.97 
 
 		 314 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  21.55 
 
 		 610 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  28.38 
 
 		 259 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  23.98 
 
 		 957 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  26.37 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  26.69 
 
 		 328 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  28.24 
 
 		 337 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  21.89 
 
 		 538 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  26.56 
 
 		 280 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2664  hypothetical protein  26.83 
 
 		 262 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  19.81 
 
 		 1018 aa  43.9  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  26.37 
 
 		 321 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>