57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0679 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  93.94 
 
 		 330 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  100 
 
 		 330 aa  670    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  51.51 
 
 		 329 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  53.31 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  58.89 
 
 		 254 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  49.19 
 
 		 479 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  47.93 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  47.54 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  47.67 
 
 		 340 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  46.38 
 
 		 340 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  47.59 
 
 		 717 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  44.55 
 
 		 711 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  46.13 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  44.06 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  45.09 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 709 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  43.58 
 
 		 252 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  39.74 
 
 		 181 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  48.53 
 
 		 102 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  26.02 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  38.2 
 
 		 102 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  38.2 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  27.8 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  26.05 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  39.62 
 
 		 106 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  25.89 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  24.89 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  25.55 
 
 		 458 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  43.48 
 
 		 125 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24.13 
 
 		 655 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  44.78 
 
 		 126 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  25.82 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  25.51 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  39.06 
 
 		 160 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  44.29 
 
 		 113 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  39.39 
 
 		 199 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  44.29 
 
 		 112 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  38.1 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  25.49 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  25.2 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  44.29 
 
 		 112 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  25.28 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  23.77 
 
 		 656 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  25.13 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30.1 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  23.75 
 
 		 580 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  23.33 
 
 		 600 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  26.03 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  21.94 
 
 		 1017 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  25.64 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  24.44 
 
 		 1017 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  30.53 
 
 		 245 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  22.63 
 
 		 252 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>