42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0993 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  38.97 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  40.99 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  40.75 
 
 		 288 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  36.17 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  35.27 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  34.16 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  26.61 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  27.55 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  27.57 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  24.5 
 
 		 600 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  22.81 
 
 		 656 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  25.26 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  28.89 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  27.95 
 
 		 790 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  26.21 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  26.67 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  24.55 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  27.64 
 
 		 664 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  26.32 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  25.31 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  24.14 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  24.01 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  24.22 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24.76 
 
 		 655 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.59 
 
 		 712 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  23.11 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  24.12 
 
 		 794 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  24.74 
 
 		 646 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  24.59 
 
 		 867 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  22.91 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1492  hypothetical protein  23 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.198935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  23.83 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  26.54 
 
 		 757 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  28.12 
 
 		 650 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0299  hypothetical protein  33.04 
 
 		 627 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  27.17 
 
 		 359 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  24.61 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  22.85 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  24.91 
 
 		 427 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  28.09 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>