56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0692 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  93.94 
 
 		 330 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  100 
 
 		 330 aa  669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  50.76 
 
 		 329 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  52.57 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  50 
 
 		 479 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  58.89 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  47.77 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  47.67 
 
 		 340 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  47.67 
 
 		 340 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  46.22 
 
 		 340 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  46.01 
 
 		 717 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  46.89 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  44.77 
 
 		 340 aa  252  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  46.51 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  43.31 
 
 		 711 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  41.9 
 
 		 709 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  43.58 
 
 		 252 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  40.38 
 
 		 181 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  52.31 
 
 		 100 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  51.52 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  23.02 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  28.22 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  37.93 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  37.93 
 
 		 102 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  26.05 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  39.62 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  42.65 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  23.15 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  34.94 
 
 		 125 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  25.91 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  22.59 
 
 		 655 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  41.43 
 
 		 113 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  41.27 
 
 		 130 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  26.03 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  43.66 
 
 		 126 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  35.06 
 
 		 160 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.04 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  44.29 
 
 		 112 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  25.61 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  44.29 
 
 		 112 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  39.39 
 
 		 199 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  26.83 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  32.69 
 
 		 135 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  23.7 
 
 		 580 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  24.8 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  26.94 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  26.75 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  32.41 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  21.88 
 
 		 1017 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  32.41 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  32.41 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  25.35 
 
 		 1017 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  26.55 
 
 		 656 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  24.61 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>