71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1996 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  100 
 
 		 343 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  74.71 
 
 		 340 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  63.77 
 
 		 340 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  60.58 
 
 		 340 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  60.58 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  54.38 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  47.77 
 
 		 329 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  46.08 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  45.88 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  45.22 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  45.71 
 
 		 717 aa  258  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  44.87 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  40.35 
 
 		 711 aa  241  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  42.28 
 
 		 709 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  39.77 
 
 		 479 aa  235  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  44.4 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  42.55 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  29.76 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  50.68 
 
 		 102 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  50.68 
 
 		 102 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  28.63 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  28.63 
 
 		 266 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  27.76 
 
 		 580 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  50.67 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  51.56 
 
 		 100 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  26.25 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  27.88 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  42.11 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  42.11 
 
 		 106 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  24.85 
 
 		 867 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  42.11 
 
 		 126 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  42.25 
 
 		 130 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  47.06 
 
 		 125 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  22.9 
 
 		 655 aa  52.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.13 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  46.58 
 
 		 113 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  24.16 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  24.01 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  47.95 
 
 		 112 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  45.21 
 
 		 112 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  24.24 
 
 		 219 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  45.21 
 
 		 112 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  24.01 
 
 		 656 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  22.49 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  26.11 
 
 		 225 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  22.49 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  23.93 
 
 		 902 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  44.62 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  22.49 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  23.11 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  23.11 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.73 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  23.11 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1492  hypothetical protein  24.88 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.198935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  21.24 
 
 		 2081 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  22.15 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1110 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  23.72 
 
 		 790 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  22.15 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  22.49 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  23.72 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  22.36 
 
 		 285 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  26.05 
 
 		 280 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  25.58 
 
 		 215 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  26.42 
 
 		 280 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  22.38 
 
 		 1329 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  27.92 
 
 		 458 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>