32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4126 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  269  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  60 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  42.55 
 
 		 276 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  46.94 
 
 		 277 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  43.37 
 
 		 256 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  32.33 
 
 		 265 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  46.99 
 
 		 266 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  38.82 
 
 		 267 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  41.89 
 
 		 340 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  42.25 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  43.66 
 
 		 340 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  35.87 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  36.84 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  38.67 
 
 		 340 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  34.31 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  41.27 
 
 		 330 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  33.05 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  36.23 
 
 		 335 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 337 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  39.68 
 
 		 350 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 479 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 330 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  40.91 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  30.97 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  40 
 
 		 329 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  36 
 
 		 709 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  38.46 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 329 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  37.7 
 
 		 717 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  38.46 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>