36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1385 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  59.34 
 
 		 340 aa  204  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  55.98 
 
 		 340 aa  185  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  54.89 
 
 		 340 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  48.63 
 
 		 340 aa  167  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  51.23 
 
 		 343 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  44.83 
 
 		 335 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  43.98 
 
 		 717 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  46.86 
 
 		 329 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  43.72 
 
 		 329 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  40.38 
 
 		 330 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 330 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  40.45 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  36.96 
 
 		 479 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  45.28 
 
 		 709 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  40.99 
 
 		 337 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  39.88 
 
 		 711 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  43.66 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  27.68 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  42.42 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  25.37 
 
 		 256 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  30.3 
 
 		 106 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  24.77 
 
 		 277 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  40.58 
 
 		 130 aa  51.6  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  26.11 
 
 		 276 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  30.19 
 
 		 125 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  46.77 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 350 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  38.16 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  36.11 
 
 		 265 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  30.93 
 
 		 102 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  31.41 
 
 		 413 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  27.84 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>